Sammen med Fachhochschule Lübeck i Tyskland har de 3 institutter CUID, ENSPAC og PAES samt RUCinnovation fået bevilliget midler fra EU’s INTERREG-program ’FehmarnbeltRegion’. Det er projektets mål at knytte et tættere netværk mellem de 2 universiteter, samtidig med at der skal udarbejdes fælles uddannelsestilbud og gennemføres forskning inden for projektets’ 3 pilotemner: Public Health, Transport og Logistik samt Interkulturel Forståelse og Sprog. På lang sigt skal det undersøges, om BeltScience kan bane vejen for et fremtidig virtuelt Femern Bælt Akademi, som en mulig del af et Østersøuniversitet.