Undersøgelse af mulig receptorbindende lomme af E. coli adhesin

Selin Arife Yüksel, Katrine Gry Gulløv & Idris Hosseini

Studenteropgave: Fagmodulprojekt

Abstrakt

Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) er en af de mest almindeligt forekommende bakterielle patogener på verdensplan og en af de hyppigste årsager til diarre. EAEC er kendetegnet ved deres evne til at adhærer til humane epitelceller via det karakteristiske ”murstensmønster” ved hjælp af aggregative adhærerende fimbriae (AAFér) som spiller en vigtig rolle for patogenesen. I dette projekt undersøges funktionen af den specifikke fimbriae variant AAF/V, som menes at være ansvarlig for kolonisering af værtscellen. Dette sker igennem en række forsøg hvor der undersøges funktionen af proteinet Agg5A igennem site-directed mutagenese på en mulig receptorbindende lomme. Desværre lykkedes det ikke at opnå det forventede resultat da transformationen ikke lykkedes. Der er en mistanke om at det var annealing temperaturen i første PCR samt de anvendte bakteriestammer som ikke har været optimale. For at undersøge den formodet receptorbindende lomme kan de samme eksperimenter udføres blot med justeringer ift. bakteriestamme, DNA-ratio og annealing temperatur.

UddannelserMolekylærbiologi, (Bachelor/kandidatuddannelse) Bachelor
SprogEngelsk
Udgivelsesdato24 maj 2019
Antal sider40
VejledereRie Jønsson

Emneord

  • EAEC
  • E.coli
  • AAF