STUDIES ON IRON OXIDATION IN THE FERRITIN FROM THE HALOARCHAEON NATRONOLIMNOBIUS INNERMONGOLICUS

Said Ferdaws Fakhri

Studenteropgave: Speciale

Abstrakt

Nanomaterialer som fx nanopartikler har været anvendt til forskellige formål inden for sundhed, elektronik, in-situ/in vivo lægemiddeltransport samt sygdomsdiagnostik og terapi. Cage-Shaped Proteins (CSP), såsom ferritin og Dps, danner den perfekte matrix til fremstilling af jern-hydroxy nanopartikler, der kan anvendes i nanoteknologi og medicin. Ferritiner er kendt som vigtige jernoplagringsproteiner, der overvinder problemerne med toksicitet og ringe biotilgængelighed af jern ved at facilitere jernoxidation og jern-mineralisering på sit aktive site, ferroxidase-center. Ferritiner fra halofile archaeabakterier har unikke egenskaber på grund af dets stærke negativladet egenskab. Denne rapport beskriver 1.8 Å resolution af ferritin med jernbundet formstruktur fra halobakterien, Natronolimnobius innermongolicus, og demonstrerer den første struktur af disse bakterier ved anvendelse af røntgenkrystallografi. I modsætning til andre ferritiner, der typisk har to jernbindingssite (FA og FB), har denne ferritin et nærliggende tredje bindingssite (Fc-site) i en sammensætning som typisk er observeret i prokaryotiske ferritiner. Fra vores kinetiske eksperimenter, observerede vi, at jernoxidationen i Natronolimnobius innermongolicus ferritin afhænger af to substitutionsaminosyrer (H53E og E130S) på FA og FB bindingsstederne. Vi observerede også at mutagenesis af H53E i FA-sitet stoppede oxidationshastigheden under forskellige betingelser afhængig af pH, NaCl og MgS04 koncentration. Glu-130 rest bøjer jernen på FB og FC bindingsstederne og en mutagenese af E130S accelererede signifikant jernoxidationshastigheden.

UddannelserMolekylærbiologi, (Bachelor/kandidatuddannelse) KandidatMedicinalbiologi, (Bachelor/kandidatuddannelse) Kandidat
SprogEngelsk
Udgivelsesdato1 feb. 2019
Antal sider53
VejledereKornelius Zeth

Emneord

  • Ferritin
  • Iron oxidation
  • N. innermongolicus